On kuitenkin muutamia asioita, jotka voivat uhkaa heitä:
* Suuremmat petolintu: Vaikka he eivät kyllästy aktiivisesti fregattibirds, suuret linnut, kuten Eagles tai Hawks, voivat mahdollisesti saalistaa poikasia tai heikentyneitä yksilöitä.
* ihmiset: Ihmisen toiminta, mukaan lukien elinympäristöjen menetys, pilaantuminen ja kalastusalus, voivat uhkaa fregattibird -populaatioita.
* loiset: Eri loiset, kuten punkit, täyt ja suolen madot, voivat vaikuttaa fregattibirdiin.
* Myrskyt ja sää: Äärimmäiset säätapahtumat voivat johtaa loukkaantumiseen tai kuolemaan.
Kaiken kaikkiaan fregattibirds ovat erittäin hyvin sopeutuneet ympäristöönsä ja niillä on vähän luonnollisia saalistajia. Heidän tärkeimmät uhat tulevat ihmisen toiminnasta ja satunnaisesta opportunistisesta petoeläimestä.