Savannah sijaitsee hurrikaanialttiisella alueella, ja kaupunki on aiemmin kärsinyt useista suurista hurrikaaneista. Viimeisin Savannahiin iskenyt hurrikaani oli hurrikaani Matthew vuonna 2016, joka aiheutti laajoja tuhoja ja tulvia.
Tulvat
Savannah on myös tulvavaarassa Savannah-joesta ja Atlantin valtamerestä. Hurrikaanien lisäksi myös rankkasateet voivat aiheuttaa tulvia kaupungissa.
Myrskytulva
Myrskytulva on hurrikaanin aiheuttama merenpinnan nousu. Myrskytulva voi aiheuttaa merkittäviä vahinkoja rannikkoyhteisöille, kuten tulvia, eroosiota ja rakennevaurioita.
Tornadot
Savannah on myös vaarassa tornadoille, vaikka ne ovat harvinaisempia kuin hurrikaanit. Tornadot voivat aiheuttaa merkittäviä vahinkoja omaisuudelle ja infrastruktuurille.
Maanjäristykset
Savannah sijaitsee seismisellä vyöhykkeellä, ja kaupunki on aiemmin kokenut useita maanjäristyksiä. Viimeisin Savannahiin iskenyt suuri maanjäristys oli vuoden 1886 Charlestonin maanjäristys, joka aiheutti laajaa vahinkoa kaupungissa.