pölytys: Kärpeillä on olennainen rooli pölytyksessä, joka on siitepölyn siirtäminen kukan osasta naispuoliseen osaan, mikä mahdollistaa hedelmöityksen ja lisääntymisen kukkivaissa kasveissa. Monet kärpäslajit, kuten hoverflies, kukkakärpäset ja tachinid -kärpäset, vierailevat kukissa ruokkiaksesi nektaria ja siitepölyä. Näin toimiessaan he kantavat tahattomasti siitepölyjyviä kukien välillä helpottaen ristipölyttämistä. Tämä prosessi on elintärkeä lukuisten kasvilajien lisääntymiselle ja geneettiselle monimuotoisuudelle.
siementen leviäminen: Jotkut kärpäslajit, erityisesti tietyntyyppiset hedelmäkärpäset, voivat levittää kasvien siemeniä. Nämä kärpäset ruokkivat hedelmiä ja nauttivat siemeniä, jotka kulkevat ruoansulatusjärjestelmänsä läpi vaurioitumatta. Kun kärpäset tallettavat jätteensä, ne hajauttavat siemenet laajemmalle alueelle, mikä edistää kasvien leviämistä ja itämistä.
biologinen monimuotoisuus: Kärpäset ovat olennainen osa biologista monimuotoisuutta. Ne toimivat ruoana erilaisille eläimille, mukaan lukien linnut, hämähäkit, matelijat ja sammakkoeläimet. Kärpästen läsnäolo ekosysteemissä ylläpitää herkkää tasapainoa ja sillä on rooli ruokalajin ja ekologisen vuorovaikutuksen ylläpitämisessä.
ravinteiden pyöräily: Kärpäset edistävät ekosysteemin ravintoaineiden pyöräilyä. Hajottajina jotkut kärpäslajit ruokkivat kuolleita orgaanisia aineita, kuten rappeutuvia hedelmiä, vihanneksia ja eläinruhoja. Hajottamalla nämä materiaalit vapauttavat välttämättömiä ravintoaineita takaisin ympäristöön, jolloin ne saavat ne saataville muiden organismien hyödyntämiseksi.
biologinen valvonta: Kärpäsiä käytetään joskus biologisina kontrolliaineina tuholaispopulaatioiden hallintaan. Esimerkiksi tiettyjä kärpäslajeja voidaan käyttää tiettyjen hyönteisten tuholaisten hallintaan maatalousympäristössä loistamalla tai saalistamalla niitä.
Lääketieteellinen ja tieteellinen tutkimus: Kärpäsiä on käytetty laajasti lääketieteellisessä ja tieteellisessä tutkimuksessa. Esimerkiksi Fruit Fly (Drosophila Melanogaster) on genetiikan ja biologian malli -organismi, joka tarjoaa näkemyksiä biologisista perusprosesseista, mukaan lukien kehitys, perintö ja käyttäytyminen.
On kuitenkin välttämätöntä huomata, että kaikki kärpäset eivät ole hyödyllisiä ja jotkut voivat olla tuholaisia tai tautivektoreita. Tuholaistorjuntakäytännöt ovat välttämättömiä kärpästen kielteisten vaikutusten minimoimiseksi samalla kun tunnustavat niiden ekologisen merkityksen ja mahdolliset hyödyt.