Vaikka heterokromiasta vastaavia spesifisiä geenejä ei ymmärretä kokonaan, sen ajatellaan liittyvän melaniinin jakautumiseen , silmien väristä vastaava pigmentti, sikiön kehityksen aikana.
On tärkeää huomata, että heterokromia on normaali variaatio eikä terveysongelma. Se ei vaikuta kissan visioon tai yleiseen terveyteen.