Aseeksuaalinen lisääntyminen:Monet yksisoluiset organismit lisääntyvät aseksuaalisesti, mikä tarkoittaa, että ne tuottavat jälkeläisiä geneettisesti identtisiä itsensä kanssa. Tällaisissa tapauksissa risteyksen käsitteestä ja geneettisen materiaalin vaihdosta eri yksilöiden välillä tulee merkityksettömäksi.
Selkeiden rajojen puute:Yksisoluiset organismit esiintyvät usein populaatioina, joissa yksilöt voivat vaihtaa geneettisiä materiaaleja erilaisten mekanismien, kuten konjugaation, muutoksen tai transduktion, avulla. Nämä prosessit voivat tapahtua geneettisesti monimuotoisten yksilöiden välillä, mikä vaikeuttaa erillisten lajien rajojen rajaamista pelkästään risteyksen perusteella.
Vaakageeninsiirto:Vaakageeninsiirto on yleinen ilmiö yksisoluisten organismien keskuudessa, joissa geenit voidaan siirtää etäisesti sukua olevien lajien välillä. Tämä voi johtaa uusien ominaisuuksien ja geneettisen monimuotoisuuden hankkimiseen, mikä monimutkaistaa lajien määritelmää risteyksen perusteella.
Nopea evoluutio:Yksisoluisilla organismeilla on usein lyhyen sukupolven aikoja ja korkea mutaatioaste, mikä johtaa nopeaan evoluutioon. Tämä tarkoittaa, että populaatiot voivat nopeasti eroa geneettisesti, mikä tekee risteyksestä etäisesti liittyvien yksilöiden välillä todennäköisemmin ajan myötä.
Lisäksi lajien käsite on ihmisen rakenne, jota käytetään elämän monimuotoisuuden luokitteluun ja ymmärtämiseen. Vaikka risteytys on hyödyllinen kriteeri lajien määrittelemiselle monissa tapauksissa, sen soveltaminen yksisoluisiin organismeihin voi olla ongelmallista niiden ainutlaatuisten ominaisuuksien ja lisääntymisstrategioiden vuoksi. Sen sijaan tutkijat luottavat usein geneettisten, fenotyyppisten ja ekologisten tietojen yhdistelmään lajien rajojen rajaamiseksi yksisoluisten organismien keskuudessa.