1. vertaileva anatomia :Vertailu eri eläinten, mukaan lukien niiden luurankojen, lihaksen, elimien ja muiden fyysisten piirteiden anatomisten rakenteiden vertailu, tarjoaa käsityksen niiden evoluutiosuhteista. Anatomisten piirteiden yhtäläisyydet viittaavat yhteiseen esi -isään. Esimerkiksi homologisten rakenteiden, kuten selkärankaisten runko, läsnäolo osoittaa läheisen suhteen selkärankaisten välillä.
2. embryologia :Alkioiden kehittymisen tutkiminen eri eläimistä voi paljastaa evoluutiosuhteita. Eri lajien alkiot käyvät usein samanlaisissa kehitysvaiheissa, mikä tarjoaa todisteita yhteisestä evoluutiohistoriasta. Esimerkiksi selkärankaisten alkioilla on nielunkaarit, jotka kehittyvät erilaisiin rakenteisiin, kuten leuat, korvaluut ja kaulan osilla.
3. paleontologia :Fossiilien tutkimus tarjoaa historiallisen tiedon menneisyydestä ja auttaa määrittämään sukupuuttoon sukupuuttoon ja olemassa olevien eläinten väliset suhteet. Tutkimalla fossiileja tutkijat voivat jäljittää eri eläinten evoluutiolinjat ja ymmärtää, kuinka ne ovat yhteydessä ajan myötä. Esimerkiksi fossiilitiedot osoittavat siirtymisen varhaisista kaloista sammakkoeläimiin ja edelleen matelijoihin, lintuihin ja nisäkkäisiin.
4. molekyylibiologia :Molekyylibiologiatekniikoiden, kuten DNA -sekvensointi ja proteiinianalyysi, edistyminen antaa tutkijoille verrata geneettistä tietoa eri eläinten välillä. Analysoimalla DNA -sekvenssejä tutkijat voivat tunnistaa yhteiset geneettiset piirteet ja rakentaa fylogeneettisiä puita, jotka edustavat evoluutiosuhteita. Eri geenien, mukaan lukien mitokondrioiden DNA, ydingeenien ja spesifisten geneettisten markkerien, vertaaminen auttaa määrittämään lajien geneettisen sukulaisuuden ja yhteisen esivanhemman.
5. Käyttäytymis- ja ekologiset todisteet :Käyttäytymisen, ekologisten markkinarakojen ja sopeutumisen yhtäläisyydet voivat myös antaa vihjeitä evoluutiosuhteista. Eläimillä, joilla on samanlainen käyttäytyminen, elinympäristöt ja mukautukset, voi olla läheinen evoluutioyhteys. Esimerkiksi kädellisten sosiaalinen käyttäytyminen, kuten yhteistyöhaluinen metsästys ja hoitaminen, viittaa heidän läheiseen evoluutiosuhteeseensa.
6. biogeografia :Eri eläinten maantieteellisen jakautumisen tutkiminen voi myös antaa tietoa evoluutiosuhteista. Lajeilla, joita löytyy samanlaisilta maantieteellisiltä alueilta ja joilla on samanlaisia sopeutumisia, voi olla yhteinen evoluutiohistoria. Biogeografiset mallit voivat auttaa rekonstruoimaan lajien leviämistä ja säteilyä ajan myötä ja tunnistamaan endemismin alueet.
Yhdistämällä todisteet näistä eri lähteistä tutkijat voivat rakentaa fylogeneettisiä puita ja määrittää eri eläinten väliset evoluutiosuhteet ymmärtämällä niiden yhteistä esi -isää ja monipuolistamismallia, jotka ovat muokanneet elämänpuun.