Ympäristöä, jossa organismi elää, kutsutaan sen elinympäristöksi. Elinympäristö on organismin luonnollinen koti tai ympäristö, josta se voi löytää ruokaa, suojaa, kavereita ja muita resursseja, jotka ovat tarpeen sen selviytymiseen. Se sisältää sekä ympäristön fyysiset että biologiset tekijät, kuten lämpötila, kosteus, maaperän tyyppi, kasvillisuus ja muiden organismien läsnäolo. Elinympäristöt voidaan luokitella erityyppeiksi niiden ominaisuuksien, kuten maanpäällisten, vesi- tai ilma -elinympäristöjen perusteella, jokaisella on omat ainutlaatuiset ympäristöolosuhteet ja organismit. Lajin elinympäristön ymmärtäminen on ekologiassa ratkaisevan tärkeää, koska se tarjoaa käsityksen niiden mukautuksista, vuorovaikutuksesta muiden organismien kanssa ja niiden yleisen ekologisen markkinaraon kanssa.