keinotekoinen valinta: Valikoivan jalostuksen kautta ihmiset vaikuttivat koiran fyysisiin ominaisuuksiin. Esimerkiksi jotkut koiranrotuja valittiin pienestä koostaan, kun taas toiset suuren koon vuoksi. Ominaisuudet, kuten turkin väri, turkispituus, pään muoto ja vartalorakenne, olivat myös ihmisen mieltymyksiä.
Käyttäytymismuutokset: Kodistaminen muutti koirien käyttäytymistä. Villi koirat pelkäävät luonnostaan ihmisiä, kun taas koirat kehittyivät sosiaalisiksi seuralaisiksi, muodostaen läheiset siteet ihmisten kanssa ja tunnustavat ihmisen vihjeet ja käskyjä.
koevoluutio: Koirien evoluutioon vaikutti myös koevoluutio ihmisten kanssa. He seurasivat ihmisiä muuttoliikkeen ja asutuksen aikana, sopeutumalla erilaisiin ympäristöihin ja muodostaen symbioottisia suhteita heidän kanssaan.
funktionaaliset piirteet: Tietyillä koiranrotuilla kehittyi erityisiä piirteitä niiden suunnitellun roolin takia. Esimerkiksi metsästyskoirilla voi olla akuutti haju tunne, paimennusrotuilla on yleensä voimakkaita paimennusvaistoja, ja seurakarit ovat tyypillisesti hellä ja seurallisia.
käyttäytymisgenetiikka: Genetiikan edistyminen on valaisevat koiranrotujen geneettisen perustan. Eri rotujen genomien tutkiminen voi auttaa tunnistamaan tiettyistä ominaisuuksista vastaavat geenit, ja selektiivinen jalostus voi vahvistaa näitä piirteitä.