Noin 358,9 miljoonaa vuotta sitten. Tässä on muutama mahdollinen selitys heidän sukupuuttoonsa:
Ilmastojen muuttaminen: Myöhäinen Devonin aika oli merkittävien ilmastomuutosten aika. Maalla koettiin sarja jääkappaleita, jotka aiheuttivat merenpinnan vaihtelut ja muutokset meriympäristöissä. Lämpimän vesiin sopeutettu Dunkleosteus on ehkä kamppaillut selviytyäkseen muuttuvissa olosuhteissa.
Kilpailu: Myöhäisellä Devonin ajanjaksolla oli monipuolistunut ja nousu muiden petoeläinryhmien, mukaan lukien erilaiset hai- ja luiskalat. Nämä kilpailijat ovat saattaneet painostaa Dunkleosteuksen ravintolähteitä ja elinympäristöjä.
ylikalastus: Dunkleosteus oli ylin saalistaja, mutta myös muiden meren saalistajien ylirakennuksen uhri. Jotkut tutkijat viittaavat siihen, että muiden petoeläimien lisääntyvä monimuotoisuus ja runsaus olisivat voineet vaikuttaa Dunkleosteuksen laskuun.
tauti: Taudin puhkeaminen tai muut terveyshaasteet olisivat voineet vaikuttaa myös Dunkleosteus -populaatioiden selviytymiseen. Tietyistä sairauksista tai taudinaiheuttajista, joilla on saattanut olla rooli heidän sukupuuttoonsa, on kuitenkin rajoitetusti tietoa.
tekijöiden yhdistelmä: On todennäköistä, että yllä olevien tekijöiden yhdistelmä yhdessä muiden tuntemattomien ympäristömuutosten kanssa johti lopulta Dunkleosteuksen sukupuuttoon. Näiden tekijöiden spesifinen sekvenssi ja suhteellinen vaikutus ovat edelleen tutkimuksen ja keskustelun alaisia paleontologien keskuudessa.