* Kromosomien lukumäärä: Ihmisillä on 23 paria kromosomeja, kun taas useimmissa apinoissa on 24 paria.
* DNA -sekvenssi: Ihmisten ja apinoiden DNA -sekvenssit ovat noin 98% identtisiä. 2%:n ero muodostaa kuitenkin miljoonat yksittäiset geneettiset variaatiot.
* geenisisältö: Ihmisillä ja apinoilla on samanlainen määrä geenejä, mutta joillakin geeneillä on erilaiset toiminnot kussakin lajissa. Esimerkiksi apinoilla ei ole geeniä, joka osallistuu ihmisten puhe- ja kielen kehitykseen ihmisillä.
* sääntelyalueet: Sääntelyalueet hallitsevat milloin ja missä geenit ilmenevät. Nämä alueet ovat usein erilaisia ihmisten ja apinoiden välillä, mikä voi johtaa eroihin geeniekspressiokuvioissa.
Ihmisen ja apinan genomien välisillä eroilla on vaikutuksia ymmärryksemme ihmisen evoluutiosta, terveydestä ja käyttäytymisestä. Tutkimalla näitä eroja tutkijat voivat saada käsityksen biologisista mekanismeista, jotka ovat muokanneet ihmisen evoluutiota ja jotka edistävät ainutlaatuisia ominaisuuksiamme lajina.