Kun useammat eurooppalaiset alkoivat käydä Mauritiuksessa ja ympäröivillä saarilla, Dodo -väestö alkoi laskea. 1700-luvun puoliväliin mennessä Dodo oli sukupuuttoon kuollut.
Dodon sukupuutto johtui suurelta osin ihmisen toiminnasta. Mauritiukseen 1500 -luvulla saapuneet hollantilaiset uudisasukkaat esittelivät saarelle sikoja, koiria ja kissoja. Nämä eläimet saalasivat Dodon munia ja nuoria, ja kilpailivat myös Dodon kanssa ruokaa varten. Lisäksi hollantilaiset merimiehet metsästivät usein ruokaa ja höyheniä varten.
Siihen mennessä, kun tutkijat alkoivat tutkia Dodoa, se oli jo sukupuuttoon sukupuuttoon. Seurauksena oli, että heidän piti luottaa varhaisten eurooppalaisten tutkijoiden tiliin ja harvoihin eloonjääneisiin Dodo -höyhenten ja luiden yksilöihin. Nämä näytteet eivät olleet kovin informatiivisia, ja tutkijoille jätettiin hyvin rajallinen käsitys Dodoista.
1900 -luvun lopulla tohtori Julian Humein johtama tutkijaryhmä aloitti uuden tutkimuksen dodoista. He käyttivät erilaisia tekniikoita, mukaan lukien tietokonemallinnus ja DNA -analyysi, Dodon ulkonäön ja käyttäytymisen rekonstruoimiseksi. Heidän tutkimuksensa paljasti, että Dodo oli paljon monimutkaisempi ja mielenkiintoisempi lintu kuin aiemmin ajateltiin.
Dodoa pidetään nyt sukupuuttoon. Se on muistutus planeettamme ekosysteemien hauraudesta ja uhanalaisten lajien suojelemisen tärkeydestä.