Predatorien osalta aikuisten virtahepoilla on yleensä hyvin vähän luonnollisia saalistajia massiivisen koon ja aggressiivisen käyttäytymisen vuoksi. Lionit, krokotiilit ja hyenat voivat kuitenkin saalistaa nuoria virtahepoja. Lionit ja hyenat voivat kohdistaa nuoriin virtahepoihin, jotka ovat kulkeneet ryhmänsä suojaamisesta tai jotka ovat haavoittuvia tiettyinä aikoina, kuten jokien ylittäminen tai veden reunan laiduntaminen. Krokotiilit voivat olla uhka nuorille virtahepolle vesistöissä, joissa molemmat lajit esiintyvät rinnakkain.