Harjasusi on kotoisin Etelä-Amerikasta ja asuu Brasilian, Argentiinan, Paraguayn ja Uruguayn niityillä, savanneilla ja metsillä. Ihmisen toiminnan vuoksi niiden luonnolliset elinympäristöt kuitenkin tuhoutuvat ja pirstoutuvat nopeasti.
Kun maa-alueita muutetaan maataloudeksi, karjan laiduntamiseen ja kaupunkikehitykseen, harjasusi menettää paitsi elinympäristönsä myös saaliinsa, johon se luottaa elantonsa saamiseksi. Hajanaiset populaatiot lisäävät entisestään sisäsiitosriskiä ja heikentävät geneettistä monimuotoisuutta, mikä on merkittävä uhka lajin pitkän aikavälin selviytymiselle.
Metsästys ja vaino:
Myös ihmiset vainoavat ja metsästävät harjasusia eri syistä. Perinteisesti ne on kohdistettu heidän turkikseensa, jota arvostetaan suuresti muotiteollisuudessa. Vaikka lait on pantu täytäntöön heidän suojelemiseksi, laiton metsästys on edelleen merkittävä uhka. Lisäksi jotkut maanviljelijät pitävät harjattua susia uhkana karjalleen, vaikka tämän väitteen tueksi on vain vähän näyttöä. Näin ollen tahalliset tappamiset ja kostotoimet edistävät lajin vähenemistä.
Yleisen tietoisuuden puute:
Harjaiset susit kohtaavat niukasti yleisön tietoisuutta niiden suojelun tasosta ja ekologisesta merkityksestä. Riittämätön tietämys ja ymmärrys lajeista sekä paikallisten yhteisöjen että poliittisten päättäjien keskuudessa estää tehokkaiden suojelustrategioiden toteuttamisen. Yleisön tietoisuuden lisääminen ja ihmisten kouluttaminen harjasuden ainutlaatuisista ominaisuuksista ja sen elinympäristön säilyttämisen tärkeydestä ovat tärkeitä askelia lajin suojelussa.
Sairaus:
Harjasusi on myös herkkä kotieläinten, erityisesti koirien, välittämille taudeille. Koiran penikkatauti, parvovirus ja raivotauti aiheuttavat merkittäviä uhkia harjaisille susiille, varsinkin kun ne uskaltavat lähelle asutusta tai kotieläinpopulaatioita. Rokotusohjelmat, terveydentilan seuranta ja kosketusten rajoittaminen kotieläinten kanssa ovat elintärkeitä taudin leviämisen vähentämisessä ja sen vaikutusten lieventämisessä harjasusipopulaatiossa.