Suuremmat lihansyöjät:
* susit: Sudet ovat kojoottien tärkein luonnollinen saalistaja, etenkin alueilla, joilla niiden alueet ovat päällekkäisiä.
* vuorileijonat: Vuorileijonat, jotka tunnetaan myös nimellä Cougars, ovat voimakkaita petoeläimiä, jotka voivat saalistaa kojootteja, etenkin vuoristoisilla alueilla.
* karhut: Vaikka karhut eivät olekaan niin usein, se voi myös metsästää kojootteja, etenkin alueilla, joilla niitä on runsaasti.
muut petoeläimet:
* bobcats: Bobcats on pienempi kuin kojootit, mutta ne voivat silti saalistaa niitä, etenkin nuoria tai heikentyneitä yksilöitä.
* Suuremmat petolintu: Kotkat, pöllöt ja haukot voivat joskus metsästää kojootteja, etenkin nuoria.
* Muut kojootit: Kilpailu voi olla kojoottipakkausten välillä voimakasta, ja ne voivat tappaa toisiaan, etenkin alueen tai resurssien suhteen.
Muut uhat:
* ihmisen toiminta: Ihmisen toiminta, kuten metsästys, ansastaminen ja elinympäristön menetys, voivat vaikuttaa merkittävästi kojootin väestöön.
* tauti ja loiset: Kojootit voivat olla alttiita sairauksille ja loisille, mikä voi heikentää niitä ja tehdä niistä alttiimpia saalistajille.
On tärkeää huomata, että tietyn saalistajan syömä kojootin todennäköisyys vaihtelee suuresti riippuen tekijöistä, kuten sijainnista, saaliin saatavuudesta ja saalistajan väestötiheydestä.