* Tutkimus: GM-eläimiä käytetään usein tutkimuksessa geenien toiminnan tutkimiseen ja uusien sairauksien hoitomuotojen kehittämiseen. Esimerkiksi GM-hiiriä on käytetty tutkimaan tiettyjen geenien roolia liikalihavuudessa, syövässä ja Alzheimerin taudissa.
* Maatalous: GM-eläimistä voidaan luoda maatalouden kannalta toivottavia ominaisuuksia, kuten lisääntynyt maidontuotanto, vastustuskyky sairauksille tai parempi lihan laatu. Esimerkiksi muuntogeenisiä sikoja on kehitetty, jotka ovat resistenttejä virukselle, joka aiheuttaa sianlihateollisuudelle kalliin taudin, joka aiheuttaa sian lisääntymis- ja hengitystieoireyhtymän (PRRS).
* Seuraeläimet: GM-eläimiä voidaan luoda myös seuraeläimiksi, joilla on halutut ominaisuudet, kuten hypoallergeeninen turkki tai tietty väri. Esimerkiksi GM-kissoja on kehitetty, jotka ovat hypoallergeenisia, mikä tekee niistä vähemmän todennäköisiä allergisia reaktioita ihmisille.
GM-eläinten luominen on kiistanalainen aihe, ja jotkut ihmiset ovat huolissaan tämän tekniikan turvallisuudesta ja eettisistä vaikutuksista. GM-eläimillä on kuitenkin potentiaalia tarjota merkittäviä etuja yhteiskunnalle, ja tämän alan tutkimus jatkuu.