torjunta -aineet :Jyrsijöiden ja muiden tuholaisten torjunta -aineet voivat myös myrkyttää preeriakoiria.
sairaudet :Preeriakoirat ovat alttiita erilaisille sairauksille, mukaan lukien sylvatic rutto, tularemia ja koiran disemper. Nämä sairaudet voivat levitä preeriakoiran pesäkkeiden keskuudessa ja aiheuttaa väestön vähentymistä.
metsästys :Joillakin alueilla preeriakoiria metsästetään urheilua varten tai karjan suojelemiseksi.
saalistus :Preeriakoirat ovat saalistaneet erilaiset saalistajat, mukaan lukien kojootit, susit, kettu ja petolintu.
Näiden tekijöiden vuoksi useita preeriakoirilajeja on lueteltu uhanalaisina tai uhanalaisina uhanalaisten lajien lain nojalla. Suojelupyrkimykset ovat käynnissä heidän elinympäristöjensä suojelemiseksi ja väestöryhmien uhkien hallitsemiseksi.