Ruoansulatuskanavan pernarutto tarttuu nauttimalla saastunutta lihaa (yleensä alikypsennetty) tai nauttimalla saastuneen veden.
Ihon pernarutto on pernaruton yleisin kliininen muoto, ja se tarttuu tartunnan saaneiden eläinten tai saastuneiden eläintuotteiden, kuten villan, nahan tai karvojen, kanssa.
Keuhkojen pernarutto tarttuu bacillus anthraciksen itiöiden hengittämisen kautta, mitä voi esiintyä teollisuustyöntekijöillä tai laboratoriohenkilöstöllä tai bioterrorismin kautta.
Injektio pernarutto on harvinaisin kliininen muoto, ja se tarttuu itiöiden ruiskeena, yleensä huumeidenkäyttäjien toimesta.