Huolimatta luonnonsuojelijoiden ja viranomaisten pyrkimyksistä kouluttaa paikallisia yhteisöjä Aye-Ayesin hyödyllisestä ekologisesta roolista, jatkuvat väärinkäsitykset, jotka johtavat näiden eläinten tahalliseen tappamiseen. Lisäksi Aye-Ayes-metsästys tapahtuu väitettyihin lääketieteellisiin tarkoituksiin tai niiden lihan kulutukseen. On kuitenkin syytä huomata, että tämä on laitonta Madagaskarin lain nojalla, ja Aye-aye-tappaminen on rangaistava huomattavilla sakolla ja mahdollisilla vankeuksilla.
Suojelupyrkimykset keskittyvät tieteellisen tutkimuksen parantamiseen, säilyttämiskoulutukseen osallistumiseen ja yhteisöpohjaisten aloitteiden toteuttamiseen Aye-Ayesin ja ihmisten välisten konfliktien lieventämiseksi. Näiden pyrkimysten tarkoituksena on suojella Aye-Ayes ja hälventää haitallisia taikauskoja tästä erittäin erikoistuneesta ja ekologisesta tärkeästä kädellislajista.