* Amazon -joki: Itse pääjoki on ensisijainen elinympäristö.
* suuret sivujoet: Tähän sisältyy joet, kuten negro, Madeira ja Xingu.
* järvet ja laguunit: Pääjoen järjestelmään kytkettynä nämä alueet tarjoavat myös sopivia ympäristöjä.
Amazon -joen delfiinin erityinen alue ulottuu lännessä sijaitsevasta Perusta idässä ja länteen Andien vuorilta itään itään.