1. Suolet: Salmonella kolonisoituu ja lisääntyy ensisijaisesti ruoansulatuskanavassa, erityisesti suolistossa. Bakteerit voivat lisääntyä nopeasti ohutsuolessa aiheuttaen tulehdusta ja siihen liittyviä oireita, kuten ripulia, vatsakipua, kuumetta ja pahoinvointia.
2. Suoliliepeen imusolmukkeet: Osana kehon immuunivastetta salmonella voi tunkeutua suoliliepeen imusolmukkeisiin, jotka sijaitsevat lähellä suolia. Näissä imusolmukkeissa bakteerit voivat lisääntyä ja aiheuttaa tulehdusta.
3. Maksa ja perna: Vakavissa tapauksissa, erityisesti invasiivisen ei-lavantautien salmonellan (iNTS) yhteydessä, bakteerit voivat levitä verenkierron kautta ja päästä maksaan ja pernaan. Täällä salmonella voi lisääntyä maksan kudoksissa ja Kupffer-soluissa ja pernan makrofageissa.
4. Sappirakko: Yksilöillä, joilla on taustalla olevia sairauksia, kuten sappikiviä tai sapen poikkeavuuksia, salmonella voi kolonisoida sappirakkoon ja lisääntyä sapessa. Tämä voi johtaa sappirakon tulehdukseen (kolekystiitti).
5. Muut sivustot: Harvinaisissa tapauksissa voi esiintyä levinneitä tauteja, jolloin Salmonella voi levitä muihin elimiin ja kudoksiin ruoansulatuskanavan ulkopuolella, kuten verenkiertoon (bakteremia), luihin, niveliin, aivokalvoihin ja sydänläppäihin. Lisääntyminen voi sitten tapahtua näissä tartunnan saaneissa paikoissa.