1. Luuranko: Luisilla kaloilla on luuranko, joka on valmistettu luusta, kun taas rustokalalla on rustosta valmistettu luuranko. Rusto on joustava, ei-mineralisoitu sidekudos, kun taas luu on kova, mineralisoitunut kudos.
2. Asteikot: Luisilla kaloilla on vaa'at, jotka on valmistettu luusta tai modifioidusta luusta, kun taas rustokalalla on vaa'at, jotka on valmistettu placoidista. Placoid-asteikot ovat pieniä, hampaan kaltaisia rakenteita, jotka ovat upotettuja ihoon.
3. Evät: Luuisilla kaloilla on evät, joita tukevat luiset säteet, kun taas rustokalalla on evät, joita tukee rustosäteet.
4. Gills: Luuisilla kaloilla on kiduksia, jotka peittävät luisen operculumin, kun taas rustokalalla on kiiltoja, joita ei ole operculum.
5. Hampaat: Luuisilla kaloilla on hampaita, jotka sijaitsevat niiden leukoissa, kun taas rustokalaissa on hampaita, jotka sijaitsevat niiden leuoilla ja kiiltokaareissa.
6. Silmät: Luuisilla kaloilla on silmät, jotka sijaitsevat päänsä sivuilla, kun taas rustokalalla on silmät, jotka sijaitsevat pään päällä.
7. Sieraimet: Luuisilla kaloilla on kaksi sieraimia, kun taas rustokalalla on yksi sierain.
8. Spiraalit: Luisilla kaloilla ei ole spiraaleja, kun taas rustokalaissa on spiraaleja, jotka ovat pieniä aukkoja päänsä päällä, jotka sallivat veden virtauksen kiduksiinsa.
9. Kaudaalinen evä (tailfin): Luuisilla kaloilla on symmetrinen kaudaalinen evä, mikä tarkoittaa, että se on saman muoto molemmin puolin, kun taas rustokalalla on epäsymmetrinen kaudaalinen evä, mikä tarkoittaa, että se on eri muodot molemmilla puolilla.