1. seksuaalinen kypsyys :Hiiret saavuttavat seksuaalisen kypsyyden noin 6-8 viikon ikäisenä. Urokset ja naaraat kykenevät lisääntymään tässä vaiheessa.
2. estrus -sykli naisilla :Naisilla hiirillä on estrus -sykli, joka on lisääntymisjakso. Tämä sykli sisältää estrus-ajanjaksot (vastaanottokyky pariutumiseen) ja diestrus (ei-reseptiivivaihe). Estrus-sykli kestää noin 4-5 päivää hiirissä ja sitä säätelevät hormonit.
3. kohteliaisuus ja parittelu :Estruksen aikana naarashiiret vapauttavat kemiallisia signaaleja (feromoneja) virtsan ja muiden tuoksumerkintöjen kautta. Nämä feromonit houkuttelevat miehiä ja laukaisevat kohteliaisuuskäyttäytymisen. Uroshiiret haisevat ja jahtaavat naista, hoitavat häntä ja näyttävät paritteluasennot. Parittelu tapahtuu, kun uros kiinnittää naisen ja asettaa peniksen emättimeen.
4. raskaus :Jos parittelu on onnistunut, naarashiiri tulee raskaaksi ja menee raskausaikaan. Hiirien raskausaika on suhteellisen lyhyt, kestää noin 20–22 päivää. Tänä aikana hedelmöitetyt munat kehittyvät alkioiksi ja implantoiksi kohdun vuoraukseen.
5. pentueen koko :Naarashiiret synnyttävät tyypillisesti 6-12 jälkeläisen pentueen, vaikka suuret pentueet eivät ole harvinaisia. Pennut ovat syntyneet altricial, mikä tarkoittaa, että he ovat avuttomia ja alikehittyneitä syntymän yhteydessä. He luottavat äitinsä ravintoa, lämpöä ja suojaa varten.
6. imetys ja vieroitus :Synnytyksen jälkeen naarashiiret tuottavat maitoa pentujensa hoitamiseksi. Imetysjakso kestää noin 3 viikkoa, jolloin pennut kasvavat nopeasti ja kehittyvät turkista, silmät auki ja alkavat tutkia ympäristöään. Noin 3-4 viikon ikäisiä pennut vieroitetaan ja alkavat syödä kiinteää ruokaa.
7. synnytyksen jälkeinen estrus :Naishiiret voivat kokea synnytyksen jälkeisen estruksen pian synnytyksen jälkeen. Tämä tarkoittaa, että heistä voi tulla jälleen hedelmällisiä, kun he hoitavat edelleen nykyistä pentuettaan.
Hiirien jalostuspareja tai pesäkkeitä pidetään usein laboratorioympäristöissä tutkimus- tai jalostustarkoituksiin. Geneettiset kannat ja spesifiset ominaisuudet voidaan selektiivisesti kasvattaa tutkimaan biologian, genetiikan ja sairausmalleja hiirissä.