Koiran siniset silmät liittyvät tyypillisesti tiettyihin geneettisiin mutaatioihin tai lääketieteellisiin tiloihin. Esimerkiksi merle-geeni, joka on vastuussa joidenkin rotujen erottuvasta täplisestä turkkikuviosta, voi myös aiheuttaa sinisiä silmiä. Tätä geeniä ei kuitenkaan yleensä löydy labradorinnoutajista.
Toinen mahdollinen syy sinisilmäisyyteen koirilla on albinismi, geneettinen sairaus, joka johtaa pigmentin puutteeseen ihossa, turkissa ja silmissä. Albinismi on kuitenkin harvinaista labradoreilla, ja se liittyy tyypillisesti muihin terveysongelmiin, kuten ihon herkkyyteen ja näköongelmiin.
Yhteenvetona voidaan todeta, että vaikka sinisiä silmiä saattaa joskus esiintyä tietyillä koiraroduilla geneettisten mutaatioiden tai lääketieteellisten sairauksien vuoksi, ne eivät ole luonnollinen tai yleinen piirre aikuisilla suklaalabradoreilla.