On kuitenkin muutamia poikkeuksia:
* Suuremmat krokotiilit: Suuremmat suolavesikrokotiilit saalistavat toisinaan pienemmät omat lajinsa, etenkin nuorten, pienemmät yksilöt. Tätä kutsutaan kannibalismiksi.
* suuret käärmeet: Joidenkin erittäin suurten käärmeiden, kuten verkkovirheiden, kuten pythonien, on tiedetty tappavan ja kuluttavan nuoria suolaveden krokotiileja.
* Muut kärjen saalistajat: Harvinaisissa tapauksissa hait, etenkin suuret härän hait, saattavat saalistaa nuoria krokotiileja, etenkin suistoympäristöissä.
On tärkeää huomata, että nämä tapaukset ovat harvinaisia ja suurin osa suolaveden krokotiileista kuolee luonnollisista syistä, kuten taudista tai vanhuudesta.
On myös mahdollisuus ihmisen puuttumiseen. Esimerkiksi jotkut ihmiset metsästävät krokotiileja, vaikka tätä on usein rajoitettu tai säännelty.