1. Ruoansulatuskanavan jätteet: Kun kilpikonnat nielevät ja sulattavat ruokansa, niiden suolistoon kerääntyy sulamatonta materiaalia.
2. Uhteen muodostuminen: Suolet imevät vettä ja ravinteita ruoasta ja jähmettävät jäljelle jääneet jätteet ulosteiksi.
3. Säilytys peräsuolessa: Muodostuneet ulosteet varastoidaan väliaikaisesti peräsuoleen, joka on paksusuolen viimeinen osa.
4. Erittyminen: Kun peräsuole tulee täyteen tai säännöllisin väliajoin, kilpikonna karkottaa ulosteet kloaakin läpi.
5. Erittyminen virtsaan: Ulosteiden lisäksi kilpikonnat erittävät kloaakin kautta typpipitoisia jätetuotteita, pääasiassa virtsahapon muodossa. Munuaiset suodattavat jätteet verenkierrosta, ja virtsaputket kuljettavat virtsan kloakaan poistumista varten.
6. Rakon säilytys (jotkut kilpikonnat): Joillakin kilpikonnalajeilla on virtsarakko, joka varastoi virtsan ennen kuin se poistuu kloaakin läpi.
On syytä huomata, että erittymistiheys voi vaihdella kilpikonnalajien välillä ja siihen voivat vaikuttaa sellaiset tekijät kuin ruokavalio, ympäristöolosuhteet ja yksilön terveys.