* saalistus: Muut petolintuja, kuten suuret sarveiset pöllöt ja kultaiset kotkat. Aikuisten kalju kotkia ei tyypillisesti saalissa, vaikka suuret saalistajat voivat tappaa ne, kuten puuvat ja karhut.
* törmäykset: Kalju kotkat voivat törmätä voimalinjojen, tuuliturbiinien ja muiden rakenteiden kanssa.
* ihmisen toiminta: Ihmiset voivat tappaa kalju kotkat metsästyksen, ansastamisen ja elinympäristön tuhoamisen kautta.