Kalju kotkan iho on tummanruskea ja öljyinen, höyhenkerros, joka auttaa eristämään sen kylmästä. Upea ihokerros, jota kutsutaan orvaskeiksi, koostuu kuolleiden solujen kerroksesta, joka on jatkuvasti vuodettu ja korvattu. Dermi tai keskikerros iho sisältää verisuonia, hermoja ja hiusrakkuloita. Sisäinen ihokerros, ihonalainen kudos, koostuu rasvasoluista, jotka auttavat pitämään kotkan lämpimänä.