* psittacofulvins ovat keltaisia, oransseja ja punaisia pigmenttejä, joita löytyy monien papukaijojen höyhenistä. Niitä tuottaa papukaijan ruumis karotenoideista, jotka ovat pigmenttejä, joita löytyy kasveista.
* Turacins ovat punaisia, violetteja ja sinisiä pigmenttejä, joita löytyy joidenkin papukaijojen höyhenistä. Niitä tuottaa papukaijan ruumis kuparioneista.
* melaniinit ovat mustia, ruskeita ja harmaita pigmenttejä, joita löytyy kaikkien papukaijojen höyhenistä. Niitä tuottaa papukaijan keho tyrosiinista, joka on aminohappo.
Näiden pigmenttien yhdistelmä antaa papukaijoille monenlaisia värejä. Joissakin papukaijoissa on kirkkaat, elinvoimaiset värit, kun taas toisissa on enemmän hillittyjä värejä. Papukaijan höyhenten värit voivat vaihdella sen lajin, iän, sukupuolen ja ruokavalion mukaan.
Pigmenttien lisäksi papukaijan höyhenen rakenne myötävaikuttaa myös sen väreihin. Höyhenet koostuvat pienistä, barb-kaltaisista rakenteista, joita kutsutaan barbuleiksi. Barbules on järjestetty tavalla, joka heijastaa valoa tietyllä tavalla, mikä antaa höyhenille niiden irontavan ulkonäön.
Papukaijojen värit ovat tärkeitä monista syistä. Ne auttavat papukaijoja naamioimaan itse saalistajilta, houkuttelemaan kavereita ja kommunikoimaan keskenään.