Jättipandat kuuluvat Ursidae-sukuun, johon kuuluvat karhut, kun taas punaiset pandat kuuluvat Ailuridae-sukuun, johon kuuluu vain punainen panda ja sen lähisukulaiset.
Näillä kahdella lajilla on erilaiset geneettiset ja fyysiset ominaisuudet, mikä tekee niiden välisen risteytymisen mahdottomaksi.