Kasvatuskauden aikana pienet auksit ruokkivat pääasiassa zooplanktonia, mukaan lukien kopot, amfipodit ja Krill. He syövät myös pieniä kaloja, kuten Sand Lancea ja muita selkärangattomia, kuten kalmaria ja katkarapuja.
Talvella, kun zooplanktonia on vähemmän runsas, pienet Auks siirtyy ruokavalioon, joka koostuu pääosin pienistä kaloista, kuten kapelin, hiekka -lanskista ja sillistä. He syövät myös joitain selkärangattomia, kuten kalmaria ja katkarapuja.
Pienet auksit ovat opportunistisia syöttölaitteita ja hyödyntävät kaikkia käytettävissä olevia ruokalähteitä. Niiden on tiedetty syövän hyönteisiä, marjoja ja jopa pieniä nisäkkäitä.