* elinympäristön menetys: Chilen flamingon elinympäristöä uhkaa ihmisen toiminta, kuten kaivostoiminta, maatalous ja kaupunkikehitys.
* metsästys: Chilen flamingoja metsästää lihaa, höyheniä ja munia.
* pilaantuminen: Kaivostoiminnan, maatalouden ja ihmisjätteen pilaantuminen on myös uhka Chilen flamingolle.
* Ilmastomuutos: Ilmastomuutos on myös suuri uhka Chilen flamingolle, koska se aiheuttaa heidän elinympäristönsä muuttuvan ja muuttuvat vähemmän sopiviksi heidän selviytymiseen.
Chilen flamingo on haavoittuva laji, ja sen populaatio vähenee. Jos näitä uhkia ei puututa, chileläinen flamingo voi kumota tulevaisuudessa.