* Öljyvuodot: Öljyvuodot voivat aiheuttaa vakavia vaurioita merisaukon turkista, mikä on välttämätöntä eristykselle ja kelluvuudelle.
* pilaantuminen: Maatalous- ja kaupunkialueiden valuminen kuljettaa torjunta -aineita, lannoitteita ja muita epäpuhtauksia, jotka saastuttavat merisaukkojen vesi- ja elintarvikkeet.
* Rannikon kehitys: Satamien, venesatamien ja muiden rannikkorakenteiden rakentaminen voi tuhota tai fragmenoida merisaukon elinympäristöä.
* Ilmastomuutos: Kasvava merenpinta, valtameren happamoituminen ja valtamerivirtojen muutokset voivat muuttaa merisaukon elinympäristöä ja ruokalähteitä.
Kun taas kalastusvälineiden takertuminen ja saalistaminen Haiden ja tappajavalaat ovat myös uhkaa, ne ovat vähemmän merkittäviä kuin elinympäristöjen menetys ja hajoaminen.
On tärkeää huomata, että erilaiset merisaukon populaatiot kohtaavat erilaisia uhkia niiden sijainnista ja erityisistä ympäristötekijöistä riippuen. Esimerkiksi Kalifornian merisaukot ovat erityisen alttiita öljyvuotoille, kun taas Alaskan alueet uhkaavat enemmän ilmastonmuutos.