Alueilla, joilla resursseja on niukasti tai niiden alueet ovat päällekkäisiä, kahden lajin välillä voi syntyä konflikteja. Kilpailu ruoka-, elinympäristö- ja metsästysalueille voi johtaa vastakkainasetteluihin ja taisteluihin.
Kun susit kohtaavat kojootteja, he voivat aktiivisesti jahdata ja hyökätä heitä määräämään tai suojelemaan alueitaan. Sudet voivat joskus tappaa kojootteja kilpailun vähentämiseksi. Tällaiset vuorovaikutukset ovat todennäköisempiä, kun saalis on rajoitettu tai jalostuskauden aikana, kun molemmat lajit puolustavat alueitaan.
Toisaalta kojootit tunnetaan sopeutumiskyvystään ja kekseliäisyydestään. Joissakin tapauksissa kojootit voivat välttää välittömiä konflikteja susien kanssa ja turvautua Susi -saaliin jäännöksiin. He saattavat myös säätää metsästyskäyttäytymistään ja välttää alueita, joilla susi on korkea.
Kaiken kaikkiaan susien ja kojoottien väliset vuorovaikutukset ovat dynaamisia ja voivat vaihdella kilpailusta ja konflikteista rinnakkaiseloon ja satunnaiseen yhteistyöhön harvinaisissa tapauksissa.