Alalaji -nimi, _famichis_, jätetään usein pois, koska ymmärretään, että termi _canis lupus_ viittaa kotimaan. Alalaji -nimeä käytetään toisinaan kotimaisen koiran erottamiseen muista _canis Lupus_ -alalajoista, kuten harmaa susi (_canis lupus lupus_) ja kojootti (_canis lupus larans_).
Kotimaisen koiran tieteellinen nimi voidaan kirjoittaa monin tavoin. Yleisin muoto on _canis lupus pervertis_, mutta se voidaan kirjoittaa myös nimellä _Canis Fepping_ tai _Canis Lupus f. tuttu_. Lyhenne _C.L. TUNNUSTA_ käytetään myös joskus.
Kotimaisen koiran tieteellinen nimi on muistutus ihmisten ja koirien välisestä läheisestä suhteesta. Koirat ovat vanhimpia kotieläimiä, ja heillä on ollut tärkeä rooli ihmishistoriassa. Niitä on käytetty metsästys-, paimentamiseen, kuljetukseen ja seuralaisuuteen. Nykyään koirat ovat edelleen rakastettuja lemmikkejä ja seuralaisia ihmisille ympäri maailmaa.