- matala geneettinen monimuotoisuus: Perustajavaikutus voi johtaa populaatioon, jolla on alhaisempi geneettinen monimuotoisuus kuin emoväestöllä, koska vain pieni alajoukko yksilöitä on mukana uuden väestön perustamisessa. Tämä johtaa korkeampaan sisäsiitoksen ja vähentyneen geneettisen variaation tasoon, mikä voi vahingoittaa populaation kykyä sopeutua ympäristöön.
- Lisääntynyt sukupuuttoriski: Pieni perustajaväestö on alttiimpi sukupuuttoon kuin massiivinen populaatio useiden tekijöiden vuoksi, mukaan lukien lisääntynyt sisäsiitos, vähentynyt geneettinen variaatio ja rajoitettu resurssien tarjonta. Sisisältö voi johtaa haitallisten piirteiden ilmentymiseen samanlaisen geneettisen materiaalin pariliitoksen vuoksi.
- evoluutioerot: Perustajavaikutus voi aloittaa evoluutioerot perustuvan väestön ja vanhempien väestön välillä. Ajan myötä perustettu väestö voi kokea erilaisia valintapaineita ja sopeutua itsenäisesti, mikä johtaa geneettisten piirteiden ja potentiaalisten spesifikaatiotapahtumien variaatioihin.
- nopea sopeutuminen: Tietyissä olosuhteissa perustajavaikutus voi johtaa nopeaan sopeutumiseen. Kun pieni väestö kokee uuden ja erilaisen ympäristön, tietyille piirteille voi olla vahvaa valintapaineita, jotka auttavat yksilöitä selviytymään uusissa olosuhteissa. Tämä voi johtaa nopeisiin muutoksiin alleelitaajuuksissa ja uusien ominaisuuksien kehityksessä.
- geneettiset häiriöt: Perustajavaikutus voi johtaa tiettyjen geneettisten häiriöiden esiintyvyyteen populaatiossa johtuen lisääntyneestä todennäköisyydestä, että henkilöt kantavat samat haitalliset alleelit. Jos perustajaväestössä on haitallisia alleeleja, ne ovat todennäköisemmin levinneitä ja vaikuttavat huomattavaan osaan väestöstä.