Suorat vaikutukset
* Kilpailu ruoasta: Uudet lajit voivat kilpailla muiden lajien kanssa samoille ruokavaroille, mikä johtaa muiden lajien populaatiokoon pienentymiseen. Esimerkiksi Niilin ahven tuominen Victoria -järvelle Afrikassa johti useiden kotoperäisten kalalajien populaation vähentymiseen, jotka eivät pystyneet kilpailemaan Niilin ahven kanssa ruokaa varten.
* Resurssien kilpailu: Uudet lajit voivat myös kilpailla muiden lajien kanssa resursseista, kuten pesimäpaikoista, suojaa tai vettä. Tämä voi johtaa muiden lajien populaatiokoon pienenemiseen tai jopa niiden sukupuuttoon. Esimerkiksi ruskean puun käärmeen käyttöönotto Guamiin johti useiden kotoperäisten lintulajien sukupuuttoon, jotka eivät kyenneet kilpailemaan käärmeen kanssa pesimäpaikkoihin.
* saalistus: Uudet lajit voivat saalistaa muita lajeja, mikä johtaa petolajien populaatiokoon pienentymiseen. Esimerkiksi punaisen kettu Australian käyttöönotto johti useiden kotoperäisten marsupialilajien väestön vähentymiseen, jotka eivät pystyneet pakenemaan kettujen saalistamista.
Epäsuorat vaikutukset
* Käyttäytymisen muutokset: Uudet lajit voivat muuttaa muiden lajien käyttäytymistä, esimerkiksi aiheuttamalla ne välttämään tiettyjä alueita tai muuttamaan niiden ruokintatapoja. Tällä voi olla erilaisia vaikutuksia ruokaketjuun, kuten Predator-Prey-suhteiden häiritseminen tai ruokavarojen saatavuuden muuttaminen. Esimerkiksi Gypsy -koi Pohjois -Amerikkaan johti muutoksiin useiden kotoperäisten lintulajien ruokintatapoissa, jotka pakotettiin syömään erityyppisiä ruokia Gypsy Mothin myrkyllisten karvojen välttämiseksi.
* Jakauman muutokset: Uudet lajit voivat myös muuttaa muiden lajien jakautumista, esimerkiksi aiheuttamalla niiden siirtymisen uusille alueille tai sukupuuttoon tietyillä alueilla. Tällä voi olla erilaisia vaikutuksia ruokaketjuun, kuten ekosysteemidynamiikan häiritseminen tai ruokavarojen saatavuuden muuttaminen. Esimerkiksi sokeriruo'on TOAD:n käyttöönotto Australiaan johti useiden kotoperäisten sammakkolajien muuttoliikkeisiin uusille alueille, jotta vältetään ruokalautasen myrkylliset ihon eritykset.
Uuden lajin käyttöönotolla voi olla erilaisia positiivisia tai kielteisiä vaikutuksia ruokaketjuun. On tärkeää harkita huolellisesti uuden lajin käyttöönoton mahdollisia vaikutuksia ennen sen tekemistä kielteisten seurausten riskin minimoimiseksi.