Linnut:
* Robin: Tämä lintu on tarinan tärkein eläin, joka usein ilmestyy Marialle ja toimii toivon ja uusimisen symbolina.
* Blackbird: Toinen lintu Mary kohtaa puutarhassa, mikä symboloi elämän ja kauneuden paluuta.
* varpunen: Yleiset linnut, jotka Mary näkee putoamisen puutarhasta, symboloivat jokapäiväistä elämää.
* sammut: Heidän kauniista kappaleestaan tunnettuja, he edustavat luonnon iloa ja rauhaa.
* Magpies: Näihin lintuihin liittyy usein huijauksia ja pahoinpitelyjä.
* Paratiisin linnut: Vaikka Dickon ei ole nimenomaisesti mainittu kirjassa, hän mainitsee näkevänsä nämä kauniit lintuja matkoillaan korostaen luonnon ihmeitä.
muut eläimet:
* koira: Colinilla on pieni koira nimeltä "Skip", joka toimii hänen seuralaisena.
* hevonen: Mary ajaa hevosta nimeltä "Black Beauty" Marthan kanssa.
* kanit: Mary kohtaa puutarhassa villit kanit, jotka edustavat salaisen tilan villiä ja vapaata luonnetta.
* hiiret: Mary ja Colin kohtaavat hiiriä puutarhassa, edustaen pieniä olentoja, jotka asuvat piilotetussa tilassa.
* lampaat: Mary näkee lampaat laiduntavan maurilla, symboloivan rauhallista ja luonnollista maailmaa puutarhan ulkopuolella.
* kissat: Vaikka kissat eivät nimenomaisesti nimetty, ne mainitaan olevan läsnä Misselthwaite -kartanossa, mikä viittaa laajemman eläinten esiintymiseen.
Salaisessa puutarhassa * olevat eläimet eivät ole vain taustaelementtejä, vaan ne toimivat usein symbolisina esityksinä teemoista, kuten toivo, uudistaminen, vapaus ja luonnon voima.