Filippiineillä on yli 11 miljoonaa hehtaaria sademetsää, mikä tekee siitä yhden maailman biologisesti monimuotoisimmista maista. Näissä metsissä asuu monenlaisia eläimiä, kuten apinoita, lintuja, matelijoita ja sammakkoeläimiä. Joitakin Filippiinien ikonisimpia sademetsäeläimiä ovat tarsieri, Filippiinien kotka ja Palawanin riikinkukko-fasaani.
2. Niityt
Filippiinien niityt sijaitsevat maan keski- ja pohjoisosissa. Näille alueille on ominaista korkea ruoho ja vähän puita. Nurmimailla asuu erilaisia eläimiä, kuten peuroja, villisikoja, lintuja ja matelijoita. Joitakin Filippiinien ikonisimpia nurmieläimiä ovat filippiinihirvi, Visayan-syylisika ja Filippiinien haukkakotka.
3. Koralliriutat
Filippiineillä on joitain maailman kauneimmista koralliriutoista. Näillä riutoilla elää monenlaista meren elämää, mukaan lukien kalat, korallit, nilviäiset ja äyriäiset. Filippiinien ikonisimpia merieläimiä ovat pellekalat, papukaijakalat ja merikilpikonna.
4. Mangrovepuut
Filippiinien mangrovemetsät löytyvät maan rannikolta. Näille alueille ovat ominaisia puut, jotka kasvavat suolaisessa vedessä. Mangrovepuut ovat koti erilaisille eläimille, mukaan lukien linnut, matelijat, sammakkoeläimet ja kalat. Joitakin Filippiinien ikonisimpia mangroveeläimiä ovat mangrovehaikara, lisko ja mudaskipper.