Ensisijainen syy siihen, miksi inkubaattori tarvitsee vettä, on kosteuden ylläpitäminen. Kosteus on tärkeää monista syistä, mukaan lukien:
* Estä munien kuivumisen. Munat koostuvat noin 70% vedestä, ja ne menettävät kosteuden, jos kosteus on liian alhainen. Tämä voi aiheuttaa alkion kuivumisen ja kuolla.
* Kaasunvaihdon helpottaminen. Hapen ja hiilidioksidin on kyettävä liikkumaan vapaasti kuoren läpi alkion hengittämiseksi. Korkea kosteus auttaa luomaan kostean ympäristön, joka mahdollistaa helpon kaasunvaihdon.
* Lämpötilan säätelemiseksi. Vesillä on korkea erityinen lämpökapasiteetti, mikä tarkoittaa, että lämpötilan muuttaminen vie paljon energiaa. Tämä auttaa pitämään inkubaattorin lämpötilan vakaana, vaikka huoneenlämpötila vaihtelee.
Useimmissa inkubaattoreissa on vesisäiliö, joka sijaitsee yksikön alaosassa. Veden haihtuessa se luo kostean ympäristön inkubaattorin sisään. Kosteusastetta voidaan hallita säätämällä säiliön veden määrää. Joissakin inkubaattoreissa on myös tuuletin, joka auttaa kiertämään ilmaa ja jakamaan kosteutta tasaisesti.