Komodo -lohikäärmeen uskotaan kehittyneen esi -isien Monitor -liskistä. Monitor -liskoja on monipuolinen liskojen ryhmä, joka löytyy eri osista maailmaa, ja ne ovat kaikki läheisesti sukulaisia. Komodo -lohikäärmeiden arvioidaan olevan peräisin Australiasta noin 15 miljoonaa vuotta sitten ja hajaantuneen Indonesian saarille, kun merenpinta laski, jolloin maalaistat voivat muodostua saarten välillä. Kun Komodo Dragons asui uudessa ympäristössään, he sopeutuivat ja tehtiin evoluutiomuutoksia, mikä johti nykyään tunnettuihin ainutlaatuisiin lajeihin.