Komodo -lohikäärmeillä on vähän saalistajia aikuisina myrkyllisen pureman ja vaikuttavan koon vuoksi hallitsevana lajina saarilla, joissa he asuvat. Ihmiset ovat heidän tärkeimpiä saalistajiaan, jotka aiheuttavat uhkia laittomasta salametsästyksestä ja elinympäristön tuhoamisesta, jotka aiheutuvat ihmisen toiminnasta.
Nuorten, jotkut petoeläimet sisältävät suurempia petoeläimiä, kuten virka -python tai suuret petolintuja, mukaan lukien Filippiinien kotka tai Marabou -turkka. Muut aikuiset lohikäärmeet tappavat ja kannibalisoivat nuoret ruoan niukkuuden läsnä ollessa.