* Tiikerit :Tiikerit ovat Jaavan sarvikuonon pääpetoeläimiä. Ne ovat suuria, voimakkaita kissoja, jotka voivat helposti tappaa sarvikuonon.
* Leopardit :Leopardit ovat toinen iso kissan tyyppi, joka voi saalistaa Jaavan sarvikuonoa. Ne eivät ole yhtä suuria kuin tiikerit, mutta ne ovat silti tarpeeksi vahvoja tappamaan sarvikuonon.
* Muut saalistajat :Muita Jaavan sarvikuonoja saalistavia saalistajia ovat krokotiilit, karhut ja hyeenat.
Ihmisuhat
* Metsästys :Jaavan sarvikuonoja metsästetään lihan, nahan ja sarvien vuoksi. Niiden lihaa pidetään herkkuna, ja niiden nahkaa käytetään nahan valmistukseen. Niiden sarvia käytetään perinteisessä aasialaisessa lääketieteessä.
* Habitat Loss :Jaavan sarvikuono elää trooppisissa sademetsissä. Kun nämä sademetsät raivataan hakkuita, maataloutta ja muuta kehitystä varten, sarvikuonot menettävät elinympäristönsä. Tämä tekee niistä alttiimpia saalistukselle ja muille uhille.
* Salametsästys :Salametsästys on suuri uhka Jaavan sarvikuonolle. Salametsästäjät tappavat sarvikuonot niiden sarvien vuoksi, joita myydään mustilla markkinoilla.
Jaavan sarvikuono on yksi maailman uhanalaisista lajeista. Niitä on vain noin 67 jäljellä luonnossa. Jaavan sarvikuonon suurimmat uhat ovat luonnolliset saalistajat, ihmisten uhkat ja salametsästys.