Trilobitit: Nämä sukupuuttoon kuolleet meren niveljalkaiset ovat laajalle levinneitä Pyreneillä. He menestyivät paleotsoisen aikakauden aikana, kambrikaudesta devonikausiin. Trilobiittifossiileja löytyy monista paikoista, kuten Kambrian liuskeista lähellä Gavarnieta Ranskassa ja Ordovician kalkkikivistä Vallibiernan alueella Espanjassa.
Ammoniitit: Ammoniitit ovat sukupuuttoon kuolleita pääjalkaisia, jotka liittyvät nykyajan kalmareihin ja seepioihin. Niitä löytyy yleisesti Pyreneiden mesozoisista kivistä, erityisesti jura- ja liitukaudella. Fossiloituneita ammoniitteja voidaan havaita kalkkikiveissä ja merleissä sellaisissa kohteissa kuin Col de Ares Ranskassa ja Sierra del Montsec Espanjassa.
Ekinoidit (merisiilit): Ekinoidit ovat meren selkärangattomia, joilla on piikit. Niiden fossiilit ovat laajalle levinneitä Pyreneillä paleotsoisesta kaudesta tertiaariin. Niitä löytyy matalista meriesiintymistä, kuten liitukauden kalkkikivistä Roncalin alueella Espanjassa.
Rudistisimpukat: Rudistisia simpukoita oli runsaasti myöhäisliitukaudella. Ne ovat suuria ja usein omituisen muotoisia, ja ne muodostavat riuttarakenteita joillakin Pyreneiden alueilla. Fossiloituneita rudisteja voidaan havaita esimerkiksi Gavarnien rotkon ja Luz-Saint-Sauveurin alueella Ranskassa sekä Ordesan ja Monte Perdidon kansallispuistossa Espanjassa.
Nummuliitit: Nummuliitit ovat sukupuuttoon kuolleita yksisoluisia foraminiferoja, jotka asuivat lämpimissä, matalissa merissä. Nummuliittifossiilit ovat yleisiä eoseenikalkkikivissä Pyreneiden alueella, erityisesti Hechon alueella Espanjassa ja Paun ja Mauléonin alueella Ranskassa.
oligoseeninisäkkäät: Pyreneet ovat myös tuottaneet tärkeitä nisäkäsfossiileja oligoseenikaudelta, kuten varhaisten kädellisten, jyrsijöiden ja lihansyöjien jäänteitä, mikä on antanut näkemyksiä näiden ryhmien varhaisesta kehityksestä.
Nämä ovat vain muutamia esimerkkejä Pyreneiltä löydetyistä erilaisista fossiileista. Vuoriston monimutkainen geologinen historia ja ympäristöolosuhteet ovat johtaneet rikkaaseen ja tärkeään paleontologiseen perintöön, joka houkuttelee edelleen tiedemiehiä ja tutkijoita ympäri maailmaa.