1. muna :Kärpäset alkavat elinkaarensa pieninä, valkoisina soikeamuotoisina munina. Nämä munat lasketaan yleensä klustereihin tai massoihin naaraskärpästen avulla eri pinnoilla, kuten ruoka, maaperä, roskat tai kostea orgaaninen aine. Munat ovat uskomattoman pieniä ja voivat olla tuskin näkyvissä paljaalla silmällä. Munien sisällä alkion kehitys tapahtuu, ja munat alkavat kehittyä maggoiksi.
2. toukka (maggot) :Munien kuoriutumisen jälkeen kärpäset saapuvat toukkavaiheeseen, jota yleisesti kutsutaan maggoiksi. Maggot ovat tyypillisesti pieniä, matomaisia olentoja, joissa on segmentoitu runko ja näkyviä päätä tai jalkoja. Niitä esiintyy yleisesti orgaanisen aineen rappeutumisessa, missä ne ruokkivat ja kasvavat aktiivisesti. Maggoteilla on suun koukut tai erikoistuneet suuosat, joiden avulla ne voivat hajottaa ja kuluttaa rappeutuvia orgaanisia materiaaleja, kuten mädäntyviä hedelmiä, vihanneksia tai eläinruhoja. Toukkavaiheen aikana maggot käyvät läpi useiden instaarien läpi, ja heittävät ulkoisen ihonsa kasvaessaan.
3. pupa (kookos) :Kun maggotit saavuttavat tietyn koon ja täydentävät toukkikehityksensä, he tulevat Pupa -vaiheeseen. Tässä vaiheessa maggotit käyvät läpi merkittävän muutoksen kovan, suojaavan ulkokuoren tai kookonin sisällä. Pupsit ovat liikkumattomia ja yleensä kiinnitetty pintaan. Kokonin sisällä maggotien vartalo tapahtuu dramaattisesti, kehittyen aikuisten kärpäsrakenteet, kuten siivet, jalat, antennit ja yhdistelmä silmät.
4. Aikuisten lento :Kun muutos on valmis, aikuisten kärpäset ilmestyvät paput. Äskettäin syntyneet kärpäset ovat pehmeitä ja värillisiä, mutta niiden ruumiinsa kovettuu ja tummenee nopeasti. Aikuisten kärpäset ovat täysin kehittyneet siivet, jolloin he voivat lentää ja liikkua vapaasti. Heillä on lävistyksiä imeviä tai spongoivat suuhun, lajista riippuen, ja ne kykenevät ruokkimaan monenlaisia ruokalähteitä, kuten nektaria, siitepölyä, mädäntyvää orgaanista ainetta tai verta (joidenkin lajien tapauksessa). Aikuiset kärpäset ovat pääasiassa lisääntymisessä, sopivien kavereiden löytämiseen ja ruoan löytämiseen. Aikuiset kärpäset munivat munat, ja elinkaari toistuu.
Kunkin vaiheen kesto ja kärpäsen koko elinkaari voivat vaihdella lajien ja ympäristöolosuhteiden, kuten lämpötilan ja kosteuden, riippuen. Yleensä aika munasta aikuiseen voi vaihdella muutamasta päivästä useisiin viikkoihin.