Aristoteles oli yksi ensimmäisistä filosofeista, joka kehitti elävien organismien luokittelujärjestelmän. Hänen järjestelmänsä perustui ajatukseen, että kaikki organismit voidaan jakaa kahteen pääryhmään:eläimet ja kasvit. Eläimet jaettiin edelleen kahteen alaryhmään:selkärankaisiin ja selkärangattomiin. Selkärankaiset ovat eläimiä, joilla on selkäranka, kun taas selkärangattomilla ei ole. Hyönteiset luokiteltiin selkärangattomiksi.
Aristoteles jakoi eläimet neljään luokkaan niiden liikkumistavan perusteella:
1. Jalankulkijat :eläimet, jotka kävelevät tai juoksevat maassa
2. Vesieläimet :vedessä elävät eläimet
3. Lentävät eläimet :eläimet, jotka lentävät
4. Matelijat :eläimet, jotka ryömivät tai liukuvat
Sekä linnut että lepakot luokiteltiin lentäviksi eläimiksi, kun taas hyönteiset jalankulkijoiksi.
Aristoteleen luokittelujärjestelmä oli suuri läpimurto biologian tutkimuksessa. Se oli ensimmäinen järjestelmä, joka yritti järjestää kaikki elävät organismit yhtenäiseksi ja hierarkkiseksi rakenteeksi. Aristoteleen järjestelmä loi perustan modernille taksonomialle, joka on elävien organismien luokittelutiede.