1. Habitat Loss: Tongan Lizard asuu pääasiassa alkuperäisiä metsäekosysteemejä 'EUA:n ja Tongatapun sisällä. Valitettavasti nämä metsän elinympäristöt on puhdistettu laajasti maatalouden, hakkuiden ja ihmisten siirtokuntien suhteen. Sopivien elinympäristöjen menetys on vähentänyt merkittävästi liskojen etäisyyttä ja väestöä.
2. Invasiivisten lajien saalistaminen: Invasiivisia lajeja, kuten luonnonvaraisia kissoja, rottia ja mangooseja, on viety Tongan saarille ja ne muodostavat vakavan uhan Tongan liskolle. Näillä invasiivisilla petoeläimillä on korkea lisääntymisnopeus ja ne ovat erittäin tehokkaita liskojen metsästyksessä ja syömisessä, mikä johtaa populaation vähenemiseen.
3. Ilmastonmuutos: Tonga, kuten muut Tyynenmeren saaret, on erittäin herkkä ilmastonmuutokselle ja merenpinnan nousulle. Muutokset lämpötilassa ja sademuodoissa vaikuttavat liskon elinympäristöön ja ravintovaroihin. Merenpinnan nousu voi myös peittää rannikon matalat elinympäristöt ja vähentää liskon levinneisyyttä entisestään.
4. Rajoitettu alue: Tongan lisko on maantieteellisesti rajoitettu kahdelle pienelle saarelle Tongassa, mikä tekee siitä haavoittuvan geneettisille ongelmille, kuten sisäsiitos ja geneettisen monimuotoisuuden puute. Kapea levinneisyys lisää myös alttiutta paikallisille uhille, kuten elinympäristöjen häviämiselle tai yksittäisille katastrofeille, jotka voivat tuhota suuren osan väestöstä.
5. Metsästys ja hyväksikäyttö: Paikalliset ovat metsästäneet Tongan liskoa ruoan ja perinteisen lääketieteen vuoksi, mikä on osaltaan vähentänyt populaatiota. Joissakin tapauksissa lisko on otettu kiinni myös lemmikkikauppaa varten, mikä heikentää sen määrää entisestään.
Elinympäristöjen häviämisen, invasiivisten lajien, ilmastonmuutoksen, rajallisen levinneisyysalueen ja metsästyksen yhdistelmä on johtanut Tongan liskojen kannan vakavaan vähenemiseen. Suojelutoimet, kuten elinympäristön ennallistaminen, petoeläinten torjunta, yleisön tietoisuus ja vankeudessa lisääntymisohjelmat, ovat ratkaisevan tärkeitä tämän äärimmäisen uhanalaisen lajin jäljellä olevien populaatioiden säilyttämiseksi.