Elinympäristön menetys on toinen suuri uhka manaateille. Manaatit luottavat mataleihin, lämpimiin vesiin selviytyäkseen, ja niiden elinympäristöä tuhoavat ihmisen toimet, kuten rannikkoalueiden kehitys, saastuminen ja ilmastonmuutos. Kun niiden elinympäristö katoaa, manaatilla on vähemmän paikkoja asua ja ruokkia, mikä voi johtaa väestön vähenemiseen ja lopulta sukupuuttoon.
Metsästys ja salametsästys ovat myös merkittäviä uhkia manaateille. Manaatteja metsästetään lihan, ihon ja öljyn vuoksi, ja ne tapetaan usein sivusaaliina kalastusvälineissä. Joillakin alueilla manaatit tappavat myös tarkoituksella ihmisten toimesta, jotka pitävät niitä tuholaisina. Metsästys ja salametsästys voivat vähentää manaattipopulaatioita ja edistää lajien sukupuuttoon.
Ilmastonmuutos on kasvava uhka manaateille. Maapallon ilmaston muuttuessa merenpinta nousee ja veden lämpötila nousee. Tämä voi häiritä manaatin ruokinta- ja lisääntymismalleja ja tehdä niistä alttiimpia taudeille. Ilmastonmuutos voi myös johtaa muutoksiin rannikon elinympäristöissä, mikä voi uhata entisestään manaattikantoja.
Vastaamalla näihin uhkiin voimme auttaa suojelemaan manaatteja ja estämään niiden sukupuuttoon kuolemisen.